時代は24世紀の地球。人間族と対等の存在であるネズミ族の英雄トッポ・ジージョは、宇宙ロケットを操縦する任務についていた。しかし、着陸艇のトラブルから、ジージョはカサリナタウンのゴミ捨て場に不時着、しかもそこはなんと400年前の時代となっていた。過去の世界にタイムスリップしてしまったジージョは、24世紀の友人ネズミ・アルノールのご先祖に助けられ、人間用の古びたアパートに住み始める。そして、ジーナという可憐な少女と出会い友達になるのだった。60年代に世界中で大人気を博したTV人形劇トッポ・ジージョを、SF的な新設定でアニメーション化。